You are not logged in | Log in

Przetwarzanie informacji w układach regulujących ekspresję genów

Speaker(s)
Aleksandra Walczak
Affiliation
Laboratoire de Physique Théorique Ecole Normale Supérieure
Date
March 8, 2013, 12:15 p.m.
Information about the event
3
Seminar
Seminar Mathematical Models of Gene Expression and Regulatory Networks

Wiele biologicznych układów regulacyjnych wewnątrz komórek można rozpatrywać jako elementy przekazujące informacje z wejść (np. stężenia czynników transkrypcyjnych lub innych cząsteczek sygnalizujących) do swoich produktów (np. poziom ekspresji różnych genów). W ramach ograniczeń na dokładność odczytu spowodowanych molekularnym charakterem elementów regulacyjnych (małe stężenia cząsteczkowe, losowość reakcji chemicznych)nie wszystkie sieci są równoważne, i maksymalizacja przekazywanych informacji dostarcza zasady optymalizacji, na podstawie której możemy starać się zrozumieć właściwości prawdziwych biologicznych układów regulacyjnych. Omówię specyficzne właściwości małych sieci optymalnie przekazujących informacje. Konkretnie, pokażę, jak forma molekularnego hałasu wpływa nie tylko na topologię sieci ale także jak parametry relacji wejścia / wyjścia w węzłach sieci zależą od molekularnych szczegółów elementów regulujących. Rozważę zależne od czasu przekazywanie informacji.