Niebywale burzliwy rozwój molekularnej biologii spowodował rosnące zapotrzebowanie na zastosowanie narzędzi matematyki i informatyki w tej dziedzinie. Jest to obecnie bardzo intensywnie rozwijający się dział nauki stanowiący przedmiot zainteresowania zarówno firm prywatnych, jak i większości wiodących uczelni wyższych. Obliczeniowa biologia molekularna jest bardzo pojemnym działem, w którym stosowane są różnorodne metody matematyki i informatyki: algorytmika, kombinatoryka, metody probabilistyczne, statystyka.
Jest to seminarium magisterskie przeznaczone głównie dla studentów informatyki na wydziale MIM UW.
Plan seminariów w semestrze zimowym roku akademickiego 2011/2012.
|
06.10.2011 |
Anna Gambin |
Omówienie tematyki seminarium. |
|
|
13.10.2011 |
Łukasz Bieniasz-Krzywiec |
Modelowanie przestrzennej struktury chromatyny. |
|
|
20.10.2011 |
Michał Startek |
Modelowanie dynamiki proliferacji transpozonów. |
|
|
27.10.2011 |
Aleksander Jankowski |
Przewidywanie kooperatywnych wiązań czynników transkrypcyjnych. |
|
|
03.11.2011 |
Michał Woźniak |
Genomika porównawcza genomów bakteryjnych. |
|
|
10.11.2011 |
Piotr Dittwald |
Modele matematyczne w analizie danych spektrometrycznych. |
|
|
17.11.2011 |
Maciej Machulec |
Aktywność transpozonów a specjacja. |
|
|
24.11.2011 |
Maciej Sykulski |
Odkrywanie rzadkich potencjalnie patologicznych rearanżacji genomowych. |
|
|
1.12.2011 |
Andrzej Pragacz |
Rola motywow sekwencyjnych w regulacji aktywnosci sekwencji promotorowych. |
|
|
08.12.2011 |
Filip Balejko |
Odwzorowanie odczytów z sekwencerów. |
|
|
15.12.2011 |
Pawel Bednarz |
Open chromatin defined by DNaseI and FAIRE identifies regulatory elements that shape cell-type identity |
|
|
5.01.2012 |
Agnieszka Podsiadło |
GlobalMIT: learning globally optimal dynamic bayesian network with the mutual information test criterion |
|
|
12.01.2012 |
Viktoria Cherednyk |
Analiza danych aCGH (fussed lasso model). |
|
|
19.01.2012 |
Joanna Giemza |
Bayesian network analysis of targeting interactions in chromatin |