| Powrót do listy seminariów |
Seminarium Biologia Obliczeniowa i Bioinformatyka
Seminarium jest poświęcone aktualnym problemom biologii obliczeniowej. Główne kierunki zainteresowań to: genomika porównawcza, proteomika, ewolucja molekularna, sieci regulacji genów, sieci przekazywania sygnałów oraz sieci oddziaływań białko-białko. Na seminarium, oprócz wyników własnych (doktorantów i pracowników), planuje się również referaty poświęcone przeglądowi literatury.
Prowadzą: Anna Gambin, Jerzy Tiuryn i Bartosz Wilczyński
Seminarium posiada własną stronę internetową.
| 2013-06-05, godz. 10:30, s. 5820 |
| Arnaud le Rouzic (CNRS, Gif-sur-Yvette) |
| Modelling the evolution of transposable elements |
| 2013-05-29, godz. 11:00, s. 5820 |
| Philippe Sabatier (Université Joseph Fourier Grenoble) |
| BioHealth Computing Program |
| 2013-05-29, godz. 10:15, s. 5820 |
| Agata Charzynska (IPI PAN) i Weronika Wronowska (Wydz. Biol. UW) |
| Modeling sphingolipid metabolism. |
| 2013-05-22, godz. 10:45, s. 5820 |
| Przemysław Biecek (Uniwersytet Warszawski) |
| Analysis of variance, data visualisation and multiple hypothesis testing in the identification of splicing events in Arabidopsis |
| 2013-05-15, godz. 10:30, s. 5820 |
| Paweł Bednarz (Uniwersytet Warszawski) |
| The problem of disovering differential regulatory elements between cell types |
| 2013-05-08, godz. 10:30, s. 5820 |
| Krisztian Buza (Uniwersytet Warszawski) |
| Assisted Genome Assembly: An introduction and initial results |
| 2013-04-17, godz. 10:30, s. 5820 |
| Bartek Wilczyński (Uniwersytet Warszawski) |
| Interesting papers from RECOMB 2013, a subjective review |
| 2013-04-10, godz. 10:30, s. 5820 |
| Jacek Patryn (IBB PAN) |
| Chromatin remodeling, a key process in regulation of global genome expression |
| 2013-04-03, godz. 10:30, s. 5820 |
| Michał Boniecki (IIMCB Warszawa) |
| SimRNA: program for RNA folding simulations. |
| 2013-03-27, godz. 10:30, s. 5820 |
| Murodzhon Akhmedov (Sabanci University, Instanbul) |
| Metaheuristic Algorithm Applications for the NMR Protein Structure-Based Assignment Problem |
| X-Ray Crystallography and Nuclear Magnetic Resonance (NMR) spectroscopy are two major experimental techniques for obtaining structural information of proteins. Since the X-Ray approach is costly and time consuming, the NMR approach is gaining great interest among researchers. The key bottleneck of NMR studies is mapping the NMR peaks to corresponding nuclei, also known as the assignment problem. The assignment problem is of NP hard type and combinatorial optimization tools and metaheuristic algorithms can be employed to perform assignments. Structure Based Assignment is an approach solving this computationally challenging problem by using prior information about the protein obtained from a homologous structure. I am involved in applying metaheuristic algorithms in the Structure Based Assignment approach. I propose Tabu Search algorithm for the Structure Based Assignment problem to achieve higher assignment accuracy. |
| 2013-03-20, godz. 10:30, s. 5820 |
| Paweł Górecki (Uniwersytet Warszawski) |
| Maximizing Deep Coalescence Cost |
| 2013-03-13, godz. 10:30, s. 5820 |
| Thierry Mora (Laboratoire de Physique Statistique, Ecole Normale Supérieure) |
| Maximum entropy models of biological data |
| Biology has many examples of systems of agents acting collectively in fundamentally different ways than they would individually. Maximum entropy models provide a useful tool for analysing these collective phenomena directly from data. We will review examples in neural networks, bird flocks and DNA binding site sequences. |
| 2013-03-06, godz. 10:30, s. 5820 |
| Aleksandra Walczak (Laboratoire de Physique Théorique, Ecole Normale Supérieure) |
| Quantifying immune receptor diversity. |
| Recognition of pathogens relies on the diversity of immune receptor proteins. Recent experiments that sequence the entire immune cell repertoires provide a new opportunity for quantitative insight into naturally occurring diversity and how it is generated. The generation process is implemented via a series of stochastic molecular events involving gene choices and random nucleotide insertions between, and deletions from, genes. I will describe how we can attempt to quantify the diversity of the receptors formed in this complex process and point to the origins of diversity in these sequences. |
| 2013-02-27, godz. 10:30, s. 5820 |
| Torgeir Hvidsten (Norwegian University of Life Sciences) |
| Comparative analysis of gene regulatory networks in plants |
We use co-expression networks to study the evolution of gene regulation in Arabidopsis, Rice and Populus. The approach highlights conservation and divergence of various network properties, rather than of protein sequence, and offers some novel perspectives related to orthologs and paralogs in plants. |
| 2013-02-20, godz. 10:15, s. 5820 |
| Dirk Valkenborg (Vision on technology - vito.be) |
| A Markov-chain-based regression model for the analysis of high-resolution enzymatically 18O-labeled mass spectra |
| To reduce the variability on the data and facilitate a statistical analysis, stable-isotope coding is often used, such that peptides from distinct groups can be pooled together and analyzed simultaneously on the mass spectrometer. In other words, protein information about different conditions appears together in a single mass spectrum and is affected by the same machine variability making a direct comparison possible. A powerful and relatively new technique for stable-isotope coding is the enzymatic labeling with oxygen isotopes containing 18 neutrons instead of the 16 neutrons most commonly observed in nature. In this setting, oxygen atoms from the carboxyl-terminus of peptides are replaced with the oxygens from heavy-oxygen-water during an enzymatic reaction with trypsine. Ideally, the series of peptide peaks (i.e. isotopic distribution) related to labeled peptides will shift 4 dalton (Da) to the right in the mass spectrum due to the incorporation of two heavy-oxygen isotopes. However, peptide-specific oxygen incorporation rate and impurities of oxygen isotopes present in the heavy-oxygen-water yield various isotope combinations on the carboxyl-terminus. As a consequence, the series of peptide peaks will not be shifted by 4 Da, but, depending on the number of oxygen isotopes introduced to the carboxyl-terminus, by 0, 1, 2, 3 or 4 Da. This will lead to multiple peptide peaks from the labeled peptide superimposing with the unlabeled peptide. This additional overlap complicates the estimation of the relative abundance and can result in a biased estimate. In order to arrive at a correct estimate of the relative abundance, the overlap needs to be taken into account in the analysis. Therefore, we propose a new method, similar in spirit to that developed by Eckel-Passow et al. (2006), which estimates the isotopic distribution, peptide-specific incorporation rate, and the abundance ratio directly from the observed mixture of peptide peaks. The method is implemented in MATLAB as a non-linear regression model. The performance of the method is illustrated using real-life datasets. |
| 2013-01-23, godz. 10:30, s. 5820 |
| Michał Komorowski (IPPT PAN) |
| How cells do statistics? Inference, signal transduction and experimental design. |
| Living cells are forced to solve inference problems as they measure constantly changing parameters of their environment. Cellular biochemical machineries encode certain experimental procedures, which, at least to some extent, must have been evolutionary optimised. Statistical methodology of optimal experimental design, therefore, can provide insight about information processing and evolutionary adaptation of signal transduction networks. We therefore explored the analogy between inference and signal transduction to provide potential design principles of biochemical networks and informative experiments. |
| 2013-01-16, godz. 10:30, s. 5820 |
| Szymon Kiełbasa (Bioinformatics Center of Expertise, Leiden University Medical Center) |
| Estimation of telomere lengths from whole-genome-sequencing data |
| 2013-01-09, godz. 10:30, s. 5820 |
| Michał Startek (MIM UW) |
| Bioinformatyczne narzędzia wykrywania transpozonów |
| 2012-12-19, godz. 10:30, s. 5820 |
| Agata Charzyńska (IPI PAN i MIM UW) |
| Variance decomposition in biomolecular models of signaling pathways. |
| 2012-12-12, godz. 10:30, s. 5820 |
| Joanna Giemza i Paweł Bednarz (MIM UW) |
| Przewidywanie funkcjonalnych elementów DNA na podstawie danych Chip-Seq |
| 2012-12-05, godz. 10:30, s. 5820 |
| Norbert Dojer (Uniwersytet Warszawski) |
| Uliniowienie wielu sekwencji przez klastrowanie residuów |
| 2012-11-28, godz. 10:30, s. 5820 |
| Michał Dąbrowski (Instytut Biologii Doświaczalnej im. Nenckiego) |
| Porównanie bibliotek: Jaspar, Transfac i Genomatics, w oparciu o dane chip-seq dla 44 czynników transkrypcyjnych |
| 2012-11-21, godz. 10:30, s. 5820 |
| Tomasz Burzykowski (Center for Statistics, Hasselt University) |
| Signal extraction and statistical modelling of peptide-centric mass spectrometry data |
| 2012-11-14, godz. 10:30, s. 5820 |
| Grzegorz Napiórkowski (II Katedra i Klinika Położnictwa i Ginekologii WUM) |
| Cukrzyca ciężarnych - możliwości zastosowania metod uczenia maszynowego w prognostyce. |
| 2012-11-07, godz. 10:30, s. 5820 |
| Andrzej Dziembowski (IBB PAN) |
| Rola nukleaz w metabolizmie RNA u eukariota |
| 2012-10-30, godz. 10:30, s. 5820 |
| Jarosław Paszek (Uniwersytet Warszawski) |
| Metryki dla drzew filogenetycznych oparte na skojarzeniach w grafie podziałów drzewa |
| 2012-10-24, godz. 10:30, s. 5820 |
| Piotr Dittwald (Uniwersytet Warszawski) |
| Za dużo, za mało, w sam raz... Analiza architektury genomu człowieka pod względem potencjalnych miejsc powstawania nawracających delecji i duplikacji |
| 2012-10-17, godz. 10:15, s. 5820 |
| Mikołaj Rybiński (Uniwersytet Warszawski) |
| Modelowanie jednorodnych układów reakcji biochemicznych: przykłady i technologie |
| 2012-10-10, godz. 10:15, s. 5820 |
| Jan Poleszczuk (Uniwersytet Warszawski) |
| Stochastyczne modele ekspresji genów - co możemy wymodelować i pomierzyć eksperymentalnie? |
| 2012-10-03, godz. 10:15, s. 5820 |
| Spotkanie organizacyjne |
| 2012-06-06, godz. 10:15, s. 5820 |
| Mikołaj Rybiński (Uniwersytet Warszawski) |
| Modelowanie skuteczności leczenia opartego na hipertermii |
| 2012-05-30, godz. 10:15, s. 5820 |
| Aleksander Jankowski (Uniwersytet Warszawski) |
| Przegląd nowych publikacji bioinformatycznych |
| 2012-05-16, godz. 10:15, s. 5820 |
| Shyam Prabhakar (Genome Institute of Singapore) |
| Widespread cooperative binding of mammalian transcription factor complexes in vivo |
| 2012-05-09, godz. 10:15, s. 5820 |
| Michał Woźniak (Uniwersytet Warszawski) |
| Kombinatoryczne stosowanie leków: przegląd literatury i baz danych |
| 2012-04-25, godz. 10:15, s. 5820 |
| Michał Startek (Uniwersytet Warszawski) |
| O transpozonach raz jeszcze |
| 2012-04-18, godz. 10:15, s. 5820 |
| Paweł Górecki (Uniwersytet Warszawski) |
| O uzgadnianiu drzew raz jeszcze |
| 2012-04-04, godz. 10:15, s. 5820 |
| Robert Szczelina (Uniwersytet Jagielloński) |
| Mocne i słabe strony metod rekonstrukcji sieci zależności genowych |
| 2012-03-28, godz. 10:15, s. 5820 |
| Magdalena Kroteń (Instytut Biochemii i Biofizyki PAN) |
| Histon łącznikowy H1 u Arabidopsis thaliana |
| 2012-03-21, godz. 10:15, s. 5820 |
| Michał Woźniak (Uniwersytet Warszawski) |
| Evolution of drug resistance and compensatory mutations: literature review |
| 2012-03-14, godz. 10:15, s. 5820 |
| Piotr Dittwald (Uniwersytet Warszawski) |
| Inverted low-copy repeats and genome instability – a genome-wide approach |
| 2012-03-07, godz. 10:15, s. 5820 |
| Aleksander Jankowski (Uniwersytet Warszawski) |
| Nowe techniki badania dostępności chromatyny: przegląd literatury |
| 2012-02-29, godz. 10:15, s. 5820 |
| Bartek Wilczyński (Uniwersytet Warszawski) |
| Jak reprezentować stan chromatyny w komputerze: przegląd literatury |
| 2012-02-22, godz. 10:15, s. 5820 |
| Jerzy Tiuryn (Uniwersytet Warszawski) |
| Ogólne podejście do uzgadniania drzew genów z drzewami gatunków |
| 2012-02-15, godz. 10:15, s. 5820 |
| Przemysław Biecek (Uniwersytet Warszawski) |
| Przedstawienie pracy „Detecting Novel Associations in Large Data Sets”, David N. Reshef et al., Science (2011) |
| 2012-01-18, godz. 10:15, s. 5820 |
| Norbert Dojer (Uniwersytet Warszawski) |
| Efektywne mapowanie odczytów z sekwencera zawierających błędy |
| 2012-01-11, godz. 10:15, s. 5820 |
| Aleksander Jankowski (Uniwersytet Warszawski) |
| Przegląd nowych publikacji bioinformatycznych |
| 2012-01-04, godz. 10:15, s. 5820 |
| Piotr Dittwald (Uniwersytet Warszawski) |
| Modelowanie danych spektrometrycznych (algorytm do liczenia obwiedni izotopowych) |
| 2011-12-21, godz. 10:15, s. 5820 |
| Marta Prymakowska-Bosak (Instytut Biochemii i Biofizyki PAN) |
| Analiza globalnych zmian transkryptomu komórek T87 Arabidopsis thaliana w odpowiedzi na stres abiotyczny |
| 2011-12-14, godz. 10:15, s. 5820 |
| Michał Komorowski (Instytut Podstawowych Problemów Techniki PAN) |
| Statistics for dynamical models of biochemical systems |
| 2011-12-07, godz. 10:15, s. 5820 |
| Michał Woźniak (Uniwersytet Warszawski) |
| Predykcja oporności na antybiotyki w bakteriach na podstawie sekwencji genomowych |
| 2011-11-30, godz. 10:15, s. 5820 |
| Paweł Górecki (Uniwersytet Warszawski) |
| Nowe algorytmy dla uzgadniania nieukorzenionych drzew genów i ukorzenionych drzew gatunków |
| 2011-11-23, godz. 10:15, s. 5820 |
| Michał Dąbrowski (Instytut Biologii Doświadczalnej im. M. Nenckiego PAN) |
| Baza danych TRAM – łatwy dostęp i integracja danych użytkownika z Ensembl funcgen |
| 2011-11-16, godz. 10:15, s. 5820 |
| Teresa Przytycka (National Center for Biotechnology Information, Bethesda, Maryland, USA) |
| Toward bridging the gap between genotype and phenotype – systems biology approach |
| 2011-11-09, godz. 10:15, s. 5820 |
| Bartek Wilczyński (Uniwersytet Warszawski) |
| Chwytanie obszarów regulatorowych na gorącym uczynku w sieci Bayesowskie |
| 2011-11-02, godz. 10:15, s. 5820 |
| Michał Woźniak (Uniwersytet Warszawski) |
| CAMBer: an approach to support comparative analysis of multiple bacterial strains |
| 2011-10-26, godz. 10:15, s. 5820 |
| Aleksander Jankowski (Uniwersytet Warszawski) |
| Predicting cell type-specific transcription factor cooperative binding |
| 2011-10-19, godz. 10:15, s. 5820 |
| Łukasz Bieniasz-Krzywiec (Uniwersytet Warszawski) |
| Odtwarzanie interakcji chromatyny na podstawie danych o modyfikacjach histonów |
| 2011-10-12, godz. 10:15, s. 5820 |
| Wiesława Widłak (Instytut Onkologii, Oddział w Gliwicach) |
| Komórkowo-swoisty mechanizm apoptozy indukowanej przez stres |
| 2011-10-05, godz. 10:15, s. 5820 |
| Ewa Szczurek (Max Planck Institute for Molecular Genetics) |
| Modeling genetic interactions in cancer |
| 2011-06-01, godz. 10:15, s. 5820 |
| Bartek Wilczyński (Uniwersytet Warszawski) |
| Simulating stochastic cell populations |
| 2011-05-25, godz. 10:15, s. 5820 |
| Bartek Wilczyński (Uniwersytet Warszawski) |
| Finding transcription factors involved in development by motif enrichment in enhancers targeted by feed-forward regulation |
| 2011-05-18, godz. 10:15, s. 5820 |
| Paweł Daniluk (Uniwersytet Warszawski) |
| Alignment of protein structures |
| 2011-05-11, godz. 10:15, s. 5820 |
| Anna Gambin (Uniwersytet Warszawski) |
| Genomic hypomethylation in the human germline associates with structural mutability in the human genome |
| 2011-05-04, godz. 11:00, s. 5820 |
| Julia Romanowska (Uniwersytet Warszawski) |
| Yet another clustering method for molecular dynamics simulations' data |
| 2011-05-04, godz. 10:15, s. 5820 |
| Julia Romanowska (Uniwersytet Warszawski) |
| Physicochemical features of aminoglycoside modifying enzymes |
| 2011-04-20, godz. 10:15, s. 5820 |
| Przemysław Biecek (Uniwersytet Warszawski) |
| Selected papers from RECOMB 2011 |
| 2011-04-13, godz. 10:15, s. 5820 |
| Norbert Dojer (Uniwersytet Warszawski) |
| Text indexes and sequencing read mapping |
| 2011-04-06, godz. 10:15, s. 5820 |
| Paweł Górecki (Uniwersytet Warszawski) |
| Przegląd nowych publikacji bioinformatycznych |
| 2011-03-30, godz. 10:15, s. 5820 |
| Bartek Wilczyński (Uniwersytet Warszawski) |
| Finding transcription factors involved in development by motif enrichment in enhancers targeted by feed-forward regulation |
| 2011-03-23, godz. 10:15, s. 5820 |
| Aleksander Jankowski (Uniwersytet Warszawski oraz Genome Institute of Singapore) |
| The determinants of nucleosome organisation |
| 2011-03-16, godz. 10:15, s. 5820 |
| Shyam Prabhakar (Genome Institute of Singapore) |
| Optimal signal detection and signal estimation from next-gen sequence tag profiles |
| 2011-03-09, godz. 10:15, s. 5820 |
| Paweł Sowiński (Uniwersytet Warszawski) |
| Rhythmic diel pattern of gene expression in maize – nocturnal life of plants |
| 2011-03-02, godz. 10:15, s. 5820 |
| Tomasz Gambin (Politechnika Warszawska) |
| Design of experiments and genomic data analysis in array-based CGH technology |
| 2011-02-23, godz. 10:15, s. 5820 |
| Przemysław Biecek (Uniwersytet Warszawski) |
| Selected papers from the computational statistics conference Neural Information Processing Systems (NIPS) |
| 2011-02-16, godz. 10:15, s. 5820 |
| Maciej Sykulski (Uniwersytet Warszawski) |
| Semantic Internet for bioinformatics – state of the art and perspectives |
| 2011-01-19, godz. 10:15, s. 5820 |
| Jerzy Tiuryn (Uniwersytet Warszawski) |
| Sequencing: from first to third generation. An overview |
| 2011-01-12, godz. 10:15, s. 5820 |
| Julia Romanowska (Uniwersytet Warszawski) |
| Comparative analysis of aminoglycosidic antibiotics' binding sites |
| 2011-01-05, godz. 10:15, s. 5820 |
| Andrzej Jerzmanowski (Uniwersytet Warszawski) |
| Global methods of chromatine mapping in the studies of functional organization of genomes |
| 2010-12-15, godz. 10:15, s. 5820 |
| Mikołaj Rybiński (Uniwersytet Warszawski) |
| Model-based testing for heterogenity of the cell membrane receptors |
| 2010-12-08, godz. 10:15, s. 5820 |
| Paweł Górecki (Uniwersytet Warszawski) |
| Przegląd nowych publikacji bioinformatycznych |
| 2010-12-01, godz. 10:15, s. 5820 |
| Janusz Dutkowski (University of California, San Diego) |
| Odkrywanie kombinatorycznych kompleksów białkowych |
| 2010-11-24, godz. 10:15, s. 5820 |
| Piotr Dittwald (Uniwersytet Warszawski) |
| Analiza statystyczna układu nerwowego Caenorhabditis elegans |
| 2010-11-17, godz. 10:15, s. 5820 |
| Michał Startek (Uniwersytet Warszawski) |
| Dynamika amplifikacji transpozonów roślinnych |
| 2010-11-10, godz. 10:15, s. 5820 |
| Paolo Missier (University of Manchester) |
| Programming scientific data pipelines with the Taverna workflow management system |
| 2010-11-03, godz. 10:15, s. 5820 |
| Norbert Dojer (Uniwersytet Warszawski) |
| Bi-billboard: symetryzacja i odpowiedni wybór gatunku referencyjnego poprawiają predykcje elementów regulatorowych |
| 2010-10-27, godz. 10:15, s. 5820 |
| Paweł Górecki (Uniwersytet Warszawski) |
| Korekcja błędów w modelu drzew uzgadniających |
| 2010-10-20, godz. 10:15, s. 5820 |
| Jerzy Tiuryn (Uniwersytet Warszawski) |
| Uzgadnianie anotacji genomów blisko spokrewnionych szczepów bakterii |
| 2010-10-13, godz. 10:15, s. 5820 |
| Mikołaj Rybiński (Uniwersytet Warszawski) |
| Usługi sieciowe Taverny do analizy modeli systemów biologicznych |
| 2010-10-06, godz. 10:15, s. 5820 |
| Przemysław Biecek (Uniwersytet Warszawski) |
| Przegląd referatów z konferencji useR2010 |
| 2010-06-02, godz. 10:15, s. 5820 |
| Przemysław Biecek (Uniwersytet Warszawski) |
| Semi-supervised learning: teoria, oprogramowanie i przykłady zastosowania do danych biologicznych na podstawie pracy Szczurek et al. 2010 |
| 2010-05-26, godz. 10:15, s. 5820 |
| Agnieszka Ludwikow (Uniwersytet Adama Mickiewicza) |
| Flipping the switch on stress tolerance ABI1 PP2C functional association network |
| 2010-05-19, godz. 10:15, s. 5820 |
| Michał Startek (Uniwersytet Warszawski) |
| Modelowanie ewolucji transpozonów roślinnych |
| 2010-05-12, godz. 10:15, s. 5820 |
| Shyam Prabhakar (Genome Institute of Singapore) |
| Biophysical modeling of ChIP-seq data reveals complexity of protein-DNA binding in vivo |
| 2010-05-05, godz. 10:15, s. 5820 |
| Aleksander Jankowski (Uniwersytet Warszawski) |
| Przewidywanie miejsc wiązania czynników transkrypcyjnych w obecności nukleosomów |
| 2010-04-28, godz. 10:15, s. 5820 |
| Bogusław Kluge (Uniwersytet Warszawski) |
| Model proteolizy uwzględniający czas |
| 2010-04-21, godz. 10:15, s. 5820 |
| Maciej Sykulski (Uniwersytet Warszawski) |
| Przegląd nowych publikacji bioinformatycznych |
| 2010-04-14, godz. 10:15, s. 5820 |
| Ewa Szczurek (Max Planck Institute for Molecular Genetics oraz Uniwersytet Warszawski) |
| Odkrywanie deregulacji genów poprzez eksperymenty perturbacyjne |
| 2010-03-31, godz. 10:15, s. 5820 |
| Michał Woźniak (Uniwersytet Warszawski) |
| Porównanie ośmiu szczepów M. tuberculosis w obecności danych o oporności na leki |
| 2010-03-24, godz. 10:15, s. 5820 |
| Bogusław Kluge (Uniwersytet Warszawski) |
| Przegląd nowych publikacji bioinformatycznych |
| 2010-03-17, godz. 10:15, s. 5820 |
| Maciej Sykulski (Uniwersytet Warszawski) |
| Gromadzenie, analiza i wnioskowanie z danych aCGH (mikromacierze DNA) |
| 2010-03-10, godz. 10:15, s. 5820 |
| Bartek Wilczyński (Uniwersytet Warszawski) |
| Jakościowa predykcja ekspresji genów w modelu probabilistycznym |
| 2010-03-03, godz. 10:15, s. 5820 |
| Andrzej Jerzmanowski (Uniwersytet Warszawski) |
| Kompleksy przebudowujące chromatynę u roślin – stan wiedzy na dziś i perspektywy badań |
| 2010-02-24, godz. 10:15, s. 5820 |
| Anna Gambin (Uniwersytet Warszawski) |
| Modelowanie procesu proteolizy |
| 2010-02-17, godz. 10:15, s. 5820 |
| Norbert Dojer (Uniwersytet Warszawski) |
| Przegląd nowych publikacji bioinformatycznych |
| 2010-01-20, godz. 10:15, s. 5820 |
| Magdalena Rowicka (Sealy Center for Molecular Medicine, University of Texas Medical Branch at Galveston) |
| Analiza danych genomicznych oparta na teorii informacji |
| 2010-01-13, godz. 10:15, s. 5820 |
| Limsoon Wong (National University of Singapore) |
| Topology of PPI Networks - Applications and Questions |
| 2010-01-06, godz. 10:15, s. 5820 |
| Paweł Górecki (Uniwersytet Warszawski) |
| Maksymalizacja wiarygodności w modelu drzew uzgadniających |
| 2009-12-16, godz. 10:15, s. 5820 |
| Wiesława Widłak (Instytut Onkologii, Gliwice) |
| Analiza porównawcza globalnych wzorów wiązania czynnika transkrypcyjnego HSF1 i profili ekspresji genów swoistych dla hepatocytów i spermatocytów |
| 2009-12-09, godz. 10:15, s. 5820 |
| Michał Woźniak (Uniwersytet Warszawski) |
| Dane molekularne dla M. tuberculosis i możliwości ich wykorzystania do walki z opornością na leki |
| 2009-12-02, godz. 10:15, s. 5820 |
| Aleksander Jankowski (Uniwersytet Warszawski) |
| Od danych chip-seq do profilu wiązania czynnika transkrypcyjnego (kontynuacja) |
| 2009-11-25, godz. 10:15, s. 5820 |
| Aleksander Jankowski (Uniwersytet Warszawski) |
| Od danych chip-seq do profilu wiązania czynnika transkrypcyjnego |
| 2009-11-18, godz. 10:15, s. 5820 |
| Mikołaj Rybiński (Uniwersytet Warszawski) |
| Niejednorodność receptorów na membranie komórkowej |
| 2009-11-04, godz. 10:15, s. 5820 |
| Jakub Koperwas (Instytut Informatyki, Politechnika Warszawska) |
| Analiza drzew o poetykietowanych liściach w kontekście problemu konkurujących hipotez ewolucyjnych |
| 2009-10-28, godz. 10:15, s. 5820 |
| Michał Startek (Uniwersytet Warszawski) |
| Modelowanie procesu amplifikacji retrotranspozonów rodziny Alu |
| 2009-10-21, godz. 10:15, s. 5820 |
| Norbert Dojer (Uniwersytet Warszawski) |
| Omówienie prac z konferencji RECOMB Comparative Genomics 2009 |
| 2009-10-14, godz. 10:15, s. 5820 |
| Janusz Dutkowski (Uniwersytet Warszawski) |
| Przegląd nowych publikacji bioinformatycznych |
| 2009-10-07, godz. 10:15, s. 5820 |
| Michał Woźniak (Uniwersytet Warszawski) |
| Badania nad powstawaniem oporności M. tuberculosis na leki |
| 2009-03-11, godz. 10:15 - 12, s. 5820 |
| Daniel Wójcik (Instytut im. Nenckiego) |
| Czy neuroinformatyka to cos dla informatyka? |
| 2009-03-04, godz. 10:15 - 12, s. 5820 |
| Boguslaw Kluge (Uniwersytet Warszawski) |
| Przeglad nowych publikacji bioinformatycznych |
| 2008-12-17, godz. 10:15 - 12, s. 5820 |
| Winfried Just (Dept. of Math., Ohio University, Athens, USA.) |
| "Dyskretne i niedyskretne modele sieci neuronow". |
| 2008-12-10, godz. 10:15 - 12, s. 5820 |
| Boguslaw Kluge (Uniwersytet Warszawski) |
| Niezmienniki filogenetyczne |
| 2008-12-03, godz. 10:15 - 12, s. 5820 |
| Paweł Górecki (Uniwersytet Warszawski) |
| Przeglad nowych publikacji bioinformatycznych |
| 2008-11-26, godz. 10:15 - 12, s. 5820 |
| Mikolaj Rybinski (Uniwersytet Warszawski) |
| Analiza wrazliwosci układow reakcji biochemicznych (kontynuacja) |
| 2008-11-19, godz. 10:15 - 12, s. 5820 |
| Mikolaj Rybinski (Uniwersytet Warszawski) |
| Analiza wrazliwosci układow reakcji biochemicznych |
| 2008-11-05, godz. 10:15 - 12, s. 5820 |
| Jerzy Tiuryn (Uniwersytet Warszawski) |
| Przeglad nowych publikacji bioinformatycznych |
| 2008-10-29, godz. 10:15 - 12, s. 5820 |
| Maciej Sykulski (Uniwersytet Warszawski) |
| Estymacja FDR (false discovery rate) oraz inne zagadnienia przy analizie danych aCGH (array comparative genomic hybridization). |
Więcej informacji: http://bioputer.mimuw.edu.pl/seminars/mmb |
| 2008-10-22, godz. 10:15 - 12, s. 5820 |
| Przemyslaw Biecek (Uniwersytet Warszawski) |
| Monitorowanie stanu przeszczepionej nerki i problemy statystyczne zwiazane z tym zagadnieniem |
Więcej informacji: http://bioputer.mimuw.edu.pl/seminars/mmb |
| 2008-10-15, godz. 12:15 - 14, s. 3170 |
| Andrzej Mizera (Abo Akademi University & Turku Centre for Computer Science, Turku, Finlandia oraz IPPT PAN) |
| Modelowanie odpowiedzi bialkowej na szok termiczny w komorce eukariotycznej |
| 2008-10-01, godz. 10:15 , s. 5820 |
| Ewa Szczurek (MaxPlank Institute, Berlin oraz MIM UW) |
| Talk and crosstalk properties emerging from cause-effect experimental data |
Więcej informacji: http://bioputer.mimuw.edu.pl/seminars/mmb |
| 2003-01-07, godz. 12:15 - 14, s. 3170 |
| Krzysztof Ginalski (ICM UW, BioInfoBank Institute) |
| CASP5 -- modelowanie struktury bialek w oparciu o podobienstwo sekwencyjne |