Rok akademicki 03/04

• Wykład monograficzny: Wstep do biologii obliczeniowej
• EGZAMIN   12.02.04 godz. 14.30 pok. 5770
• Wykład 1 : wstep biologiczny ( biologia.ps  )
• Wyklad 2 : uliniowienie globalne 2 sekwencji (podob_2_sekw-1.ps)
• Wyklad 3 : uliniowienie lokalne 2 sekwencji (lok_podob_2_sekw.ps )
• Wyklad 4 : algorytmy heurystyczne; statystyczna istotnosc w algorytmie BLAST (Statistical Methods in Bioinformatics: An Introduction W.J. Ewens, G. R. Grant rozdzial 9)
• Wyklad 5 : estymacja statystyczna; testowanie hipotez    (Statistical Methods in Bioinformatics: An Introduction  W. J. Ewens, G. R. Grant rozdzial 8 )
• Wyklad 6 : lancuchy Markowa; modele ewolucji sekwencji (modele.ps )
• Wyklad 7 : wprowadzenie do filogenetyki (met_macierzowe.ps , parsymonia.ps )
• Wyklad 8 : probabilistyczne podejscie do rekonstrukcji drzew (prob.ps )
• Wyklad 9 : ukryte lancuchy Markowa ( R. Durbin, S. Eddy, A. Krogh, G. Mitchinson "Biological Sequence Analysis", rozdzial 3)
• Wyklad 10 : zagadnienia ekspresji genow,   mikromacierze DNA (P. Pevzner Computational Molecular Biology: an Algorithmic Approach rozdzial 5)
• Wyklad 11 : organizacja genomow; wprowadzenie, sortowanie przez zamiane blokow ( slajdy BI.ps)
• Wyklad 12 :   Uliniowienie wielu sekwencji: miara typu SP: (sp.ps)
• Wyklad 13 : Uliniowienie z drzewem filogenetycznym.     (filogen.ps ) Wielomianowy schemat aproksymacji.  ( ptas.ps )
• Seminarium magisterskie:  Obliczeniowa biologia molekularna
• strona seminarium
• seminarium:  Matematyczne metody biologii
• strona seminarium

---

• Rok akademicki 00/01
• Rok akademicki 02/03

---


Konsultacje: czwartek 10.30 - 12.00, pokoj 4240
aniag@mimuw.edu.pl