Anna Gambin
Wstęp do biologii obliczeniowej

Wykład monograficzny: poniedziałki godz. 10.15 sala 2100.

• wykład 1: sprawy organizacyjne i wstęp biologiczny.(SLAJDY: A. Gambin .pdf)
Wstęp biologiczny. (NOTATKI: J. Tiuryn .pdf)
• wykład 2: metody rekombinacji DNA, transkryptomika, proteomika. (SLAJDY: A. Gambin .pdf)
• wykład 3: globalne uliniowienie dwóch sekwencji. (NOTATKI: J. Tiuryn .pdf)
• wykład 4: lokalne uliniowienie dwóch sekwencji, przerwy w uliniowieniach. (NOTATKI: J. Tiuryn .pdf)
• wykład 5: modele ewolucji sekwencji DNA (NOTATKI: A. Gambin .pdf) Uliniowienia całych genomów (NOTATKI: B. Kluge .pdf)
• wykład 6: Algortymy FASTA i BLAST, macierze substytucyjne (NOTATKI: J. Tiuryn .pdf)

• Literatura:

1. Peter Clote, Rolf Backofen, Computational Molecular Biology: An Introduction, John Wiley \& Sons, Ltd., 2000..
2. W. J. Ewens, G. R. Grant, Statistical Methods in Bioinformatics Springer-Verlag, 2001.
3.   A. M. Campbell, L. J. Heyer Discovering Genomics, Proteomics, and Bioinformatics, Pearson Education 2003
4. R. Durbin, S. Eddy, A. Krogh, G. Mitchson, Biological Sequence Analysis, Cambridge Univ. Press, 1997.
5. P. Pevzner, Computational Molecular Biology, The MIT Press, 2000.

• Seminarium magisterskie: Molekularna biologia obliczeniowa
• Seminarium: Matematyczne metody biologii
• Seminarium środowiskowe: Biologia Obliczeniowa

Konsultacje